| Species | Name Used in Reference |
|---|---|
| Acentrogobius cenderawasih Allen & Erdmann, 2012 | Acentrogobius cenderawasih (p. fig. 7, p. 11) |
| Acentrogobius suluensis (Herre, 1927) | Acentrogobius suluensis (p. fig. 8, p. 12) |
| Acentrogobius vanderloosi Allen, 2015 | Acentrogobius vanderloosi (p. 3;fig.1-3;tab.1-2) |
| Acentrogobius violarisi Allen, 2015 | Acentrogobius violarisi (p. 8;fig.4-6;tab.1-2) |